子實層體是長在菌蓋下面產(chǎn)生子實層的部分，有的呈葉狀，叫作菌褶。有的呈管狀，叫作菌管。菌褶呈放射狀排列，向中央連接菌柄的頂部，向外到達苗蓋邊緣、子實層就排列在苗褶兩側(cè)，或存在于菌管里面的周圍。

菌褶　經(jīng)常看見的菌褶顏色，一般是孢子的顏色。幼嫩時一般是白色，老熟后變成各種不同的顏色。菌褶的形狀有寬的、窄的，三角形的。有等長的、不等長的、分叉的等。苗褶與菌褶間，有的有橫脈連接，有的在靠近菌柄的一端互相交織成網(wǎng)狀等。菌褶的邊緣通常完整平滑，但有呈波浪狀或鋸齒狀的，也有邊緣粗糙有顆粒狀物的。菌褶與菌柄連接的方式是分類的重要依據(jù)之一。通常有以下幾種。

⑴ 離生：菌褶不與菌柄連接，因而在菌褶與菌柄之間有距離。

⑵ 彎生：菌褶與菌柄連接處稍微向上彎。

⑶ 直生：菌褶直接與菌柄連接，不向下延長，也不向上彎曲。

⑷ 延生：菌褶沿菌柄向下延伸。

菌管　菌管可長可短，一般與菌褶與菌柄連接方式相似。也有離生、彎生、直生和延生等方式，有的容易和菌肉剝離，菌管間也極容易相互分離。但那些不成放射狀排列而類似菌褶的，就不容易相互分離。它們的顏色多樣，與菌管口部的顏色相同或不相同。

子實層　菌褶的兩側(cè)和菌管的里面布滿子實層。子實層中有擔(dān)子、囊狀體等。擔(dān)子通常棒狀，有四個小梗，上面各生一個擔(dān)孢子。有時只生兩個小梗，產(chǎn)生兩個擔(dān)孢子。擔(dān)孢子簡稱孢子。它的形狀、顏色、大小、花紋是蘑菇分種的重要依據(jù)之一。其形狀有圓的、卵圓的、橢圓的、圓筒形的、多角形的、星狀的等。它們的外面有一層或兩層膜，膜光滑或粗糙，有小疣、小刺、網(wǎng)紋、棱紋等。囊狀體生在擔(dān)子間，它們的起源多數(shù)如同擔(dān)子，分布在菌褶的整個表面，因為它著生位置不同，又給以不同名稱。生在菌褶兩側(cè)的叫囊狀體，生在菌褶邊緣的叫褶緣囊體。它們通常沒有顏色，但在有些種內(nèi)部有顏色，它的形狀有多種，如棒狀、紡錘狀、梭狀、瓶狀、洋梨狀等。頂端有尖細呈尾狀的、有頭圓的、有角狀的、也有頂端有結(jié)晶體的，等。